Avec le support de l’ACDI, Alternatives a lancé les projets « Pour la paix en Papouasie » ainsi que « Renforcement de la paix en Sulawesi centrale ». Ces deux initiatives cherchaient à enrayer les conflits en Indonésie orientale. Après une série de missions en Indonésie entre 1999 et 2001, le projet d’Alternatives visait à créer des opportunités économiques pour les groupes indigènes, améliorer le dialogue concernant la question de l’autonomie et renforcer les capacités de la société civile. Le succès de ce travail provient des différents réseaux de partenaires locaux établis par Alternatives afin de promouvoir un dialogue pacifique entre les différents secteurs indonésiens concernés, en favorisant une utilisation minimum des forces de l’ordre.
Le programme d’Alternatives fut dirigé et coordonné avec d’importantes ONG locales afin d’établir une étroite collaboration entre les deux pays et de favoriser l’intervention jumelée des sociétés civiles canadienne et indonésienne. Le programme s’est réalisé en partenariat avec l’INSIST (Société indonésienne pour la transformation sociale), la LATIN (industrie forestière locale), l’Yayasan FIELD (agriculture durable), Perampuan Solidaritus (genre), la Yayasan Bina Desa (Réforme agraire) et la Fondation PAKTA (renforcement des capacités d’IT et ONG).
